Microbiological Evaluation of Endophytic Bacteria in Parsley and Mint in the West Bank

Abstract

Mint (Pepper mint) and parsley (Petroselinum crispum) are two common herbal plants (fresh produce) used in Middle Eastern cuisine. Due to the high market demand, these two herbs are grown year-round in many countries including in Palestine. This study aimed to evaluate the internal (endophytic) microbial content in parsley and mint that are sampled from different markets in Hebron and Bethlehem cities. Samples were surface sterilized to eliminate epiphytic bacteria then an extract was prepared and cultured on two microbiological media, total coliform media and fecal coliform media. Bacterial genera were identified based on colony morphology. For total coliforms and fecal coliforms, CFU/g was calculated and compared between samples. No significant difference in microbial load between the commercial sources was found in both plants. No coliforms were found in the samples taken from home garden or in the negative control. Universal primers for 16S rDNA region were used to identify the bacterial species obtained from the culture step. The PCR products were sequenced and subjected to BLASTn in order to identify the sequenced bacteria. In total, seven different bacterial genera from three families were identified including Pseudomonas, Pantoea, Enterobacter, Lelliottia, Escherichia, Klebsiella and Salmonella. Furthermore, twenty-four different strains were identified from the sequenced in the two herbs. The results in this study should be considered to draw more attention regarding the food safety issues in fresh herbs quality and consumption. Key words Fresh produce, Fecal coliform, Total coliform, Endophytic bacteria النقييم الميكروبيولوجي للبكتيريا الداخلية في النباتات ال خضراء في البقدونس والنعنع في الضفة الغربية النعنع(Pepper mint) والبقدونس(Petroselinum crispum) من النباتات العشبية الشائعة المستخدمة في مطبخ الشرق األوسط . نظ ًرا الرتفاع الطلب في السوق ، تتم زراعة هذين النوعين من األعشاب على مدار العام في العديد من البلدان بما في ذلك فلسطين. هدفت هذه الدراسة إلى تقييم المحتوى الميكروبي الداخلي (endophytic)في البقدونس والنعنع المأخوذة من أسواق مختلفة في مدينتي الخليل وبيت لحم. تم تعقيم السطح الخارجي للنباتات للتخلص من البكتيريا الخارجية، ثم تم تحضير مستخلص النبات وزراعته على وسطين ميكروبيولوجيين ، (Total coliform and fecal coliform media). تال ذلك تحديد األجناس البكتيرية بنا ًء على مورفولوجيا المستعمرة. بالنسبة لل Total and fecal coliform، تم حساب CFU/g ومقارنتها بين العينات. حيث لم يتم العثور على فرق معنوي في وجود الميكروبات الداخلية بين المصادر التجارية في كال النباتين. ولم يتم العثور على القولونيات في العينات المأخوذة من حديقة المنزل أو في السيطرة السلبية. تم استخدام 16S rDNA لتحديد األنواع البكتيرية التي تم الحصول عليها من خطوة االستزراع. ثم تسلسل منتجات PCR وتعريضها لـ BLASTn من أجل التعرف على البكتيريا المتسلسلة. في المجموع ، تم تحديد سبعة أجناس بكتيرية من ثالث عائالت مختلفة كما يلي Pseudomonasو Pantoea و Enterobacter و Lelliottiaو Escherichia coli و Klebsiella و .Salmonella ،عالوة على ذلك ، تم التعرف على 24 ساللة مختلفة من البكتيريا الناتجة . ينبغي النظر في نتائج هذه الدراسة لجذب المزيد من االهتمام فيما يتعلق بقضايا سالمة األغذية في جودة األعشاب الطازجة واستهالكها.